MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 8316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021738	TTA	2	6	129435	129440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_021738	CTT	2	6	129444	129449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_021738	T	6	6	129448	129453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_021738	TC	3	6	130348	130353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
505	NC_021738	A	7	7	130405	130411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_021738	AAT	2	6	130426	130431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021738	ATT	2	6	130450	130455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021738	TAA	2	6	130466	130471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021738	GCTT	2	8	133123	133130	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
510	NC_021738	AT	3	6	135976	135981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021738	TTA	2	6	136009	136014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_021738	T	6	6	136022	136027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021738	TA	3	6	136036	136041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_021738	ATT	2	6	138346	138351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021738	T	6	6	138350	138355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_021738	A	7	7	138362	138368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_021738	T	7	7	138377	138383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021738	GA	3	6	138393	138398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021738	ATT	2	6	138410	138415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021738	T	6	6	138414	138419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021738	A	6	6	139630	139635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021738	CCA	2	6	139636	139641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_021738	GATT	2	8	139656	139663	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021738	A	6	6	139772	139777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_021738	TTG	2	6	139843	139848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_021738	GAA	2	6	139884	139889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021738	TAA	2	6	139892	139897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021738	CAA	2	6	139905	139910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_021738	TGA	2	6	139913	139918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021738	TTA	2	6	140001	140006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_021738	GAA	2	6	140064	140069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021738	AAAC	2	8	140073	140080	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
533	NC_021738	TGT	2	6	140089	140094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021738	AATTA	2	10	143770	143779	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_021738	TAT	2	6	143793	143798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_021738	TAC	2	6	143801	143806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_021738	ATTTT	2	10	143819	143828	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021738	AG	3	6	143839	143844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021738	TAAA	2	8	146562	146569	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_021738	AT	3	6	146587	146592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_021738	ATA	2	6	146605	146610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021738	ATT	2	6	147183	147188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021738	TAT	2	6	147215	147220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_021738	CAT	2	6	147227	147232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_021738	TA	3	6	147290	147295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021738	GAA	2	6	147309	147314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021738	TCA	2	6	149070	149075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_021738	TTGT	2	8	150554	150561	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
549	NC_021738	CCCG	2	8	150578	150585	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
550	NC_021738	ACC	3	9	150646	150654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_021738	CAG	2	6	150678	150683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_021738	AG	3	6	151762	151767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_021738	A	6	6	151779	151784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_021738	TGC	2	6	151836	151841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_021738	A	6	6	152447	152452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021738	ATA	2	6	152725	152730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021738	A	6	6	152776	152781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021738	T	6	6	152817	152822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_021738	TC	3	6	152858	152863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
560	NC_021738	TTTC	2	8	152877	152884	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
561	NC_021738	T	6	6	153956	153961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_021738	ATT	2	6	154346	154351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_021738	TAATCT	2	12	154403	154414	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
564	NC_021738	GTTTT	2	10	154415	154424	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021738	TGC	2	6	154479	154484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_021738	GATATA	2	12	154511	154522	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021738	A	7	7	155877	155883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_021738	GCTT	2	8	155889	155896	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
569	NC_021738	ATT	2	6	156179	156184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021738	TTAT	2	8	156196	156203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021738	ATT	2	6	156220	156225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_021738	A	6	6	156251	156256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021738	ATA	2	6	156258	156263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021738	TAT	2	6	156272	156277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_021738	CAA	2	6	158549	158554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_021738	A	6	6	158568	158573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021738	TCC	2	6	160838	160843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_021738	TCT	2	6	160859	160864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_021738	TTA	2	6	160911	160916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021738	T	6	6	160952	160957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_021738	TA	3	6	160992	160997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021738	T	6	6	161054	161059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_021738	A	6	6	161084	161089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021738	T	6	6	161104	161109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_021738	A	7	7	161123	161129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_021738	A	6	6	161896	161901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_021738	GGGA	2	8	161941	161948	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
588	NC_021738	AAAG	2	8	164101	164108	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
589	NC_021738	GAA	2	6	165379	165384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_021738	AAAT	2	8	165440	165447	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_021738	AAAG	2	8	165458	165465	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
592	NC_021738	A	6	6	165509	165514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021738	TTTCA	2	10	165562	165571	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
594	NC_021738	A	7	7	167594	167600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_021738	ATA	2	6	169207	169212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_021738	AAT	2	6	169255	169260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_021738	CCG	2	6	169262	169267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_021738	TGA	2	6	169270	169275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_021738	TAT	2	6	169284	169289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_021738	CTG	2	6	169378	169383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_021738	AAT	2	6	169392	169397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_021738	GGT	2	6	169699	169704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_021738	GT	4	8	169703	169710	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_021738	T	6	6	169710	169715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_021738	A	6	6	169720	169725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_021738	T	6	6	169772	169777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_021738	TA	3	6	169806	169811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_021738	A	7	7	170017	170023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021738	ATTT	2	8	170064	170071	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_021738	CATTT	2	10	170074	170083	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
611	NC_021738	TTA	2	6	170100	170105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_021738	CAT	2	6	171679	171684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_021738	TAATG	2	10	171696	171705	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
614	NC_021738	TAAA	2	8	171712	171719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_021738	CATT	2	8	172231	172238	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
616	NC_021738	G	6	6	172245	172250	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
617	NC_021738	CTC	2	6	172325	172330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_021738	AAC	2	6	172365	172370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_021738	CGAAG	2	10	172371	172380	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
620	NC_021738	ATG	2	6	172414	172419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_021738	ATTT	2	8	172450	172457	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_021738	GGGTA	2	10	174852	174861	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
623	NC_021738	TGAT	2	8	177307	177314	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
624	NC_021738	T	7	7	177316	177322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_021738	CGTT	2	8	177326	177333	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
626	NC_021738	ATT	3	9	177344	177352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_021738	GGT	2	6	177363	177368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NC_021738	TTAA	2	8	177382	177389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_021738	TC	3	6	177403	177408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_021738	A	6	6	177419	177424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_021738	A	7	7	177477	177483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_021738	TTA	2	6	178620	178625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_021738	TTC	2	6	179452	179457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_021738	T	6	6	179471	179476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_021738	TC	3	6	180337	180342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
636	NC_021738	AAC	2	6	180385	180390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_021738	ATG	2	6	181901	181906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_021738	CAA	2	6	181939	181944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_021738	A	7	7	181960	181966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_021738	A	6	6	181971	181976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_021738	TAAA	2	8	183513	183520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_021738	GA	3	6	183556	183561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
643	NC_021738	GTC	2	6	183580	183585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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